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A bioinformatics pipeline for Mycobacterium tuberculosis sequencing that cleans contaminant reads from sputum samples.

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Title: A bioinformatics pipeline for Mycobacterium tuberculosis sequencing that cleans contaminant reads from sputum samples.
Authors: Cuevas-Córdoba B; Laboratorio de Farmacogenómica, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Ciudad de México, México.; Instituto de Investigaciones Biológicas, Universidad Veracruzana, Xalapa, Veracruz, México., Fresno C; Departamento de Desarrollo Tecnológico, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Ciudad de México, México., Haase-Hernández JI; Departamento de Desarrollo Tecnológico, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Ciudad de México, México., Barbosa-Amezcua M; Laboratorio de Farmacogenómica, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Ciudad de México, México., Mata-Rocha M; Laboratorio de Farmacogenómica, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Ciudad de México, México., Muñoz-Torrico M; Clínica de Tuberculosis y Enfermedades Pleurales, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER), Ciudad de México, México., Salazar-Lezama MA; Clínica de Tuberculosis y Enfermedades Pleurales, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER), Ciudad de México, México., Martínez-Orozco JA; Clínica de Tuberculosis y Enfermedades Pleurales, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER), Ciudad de México, México., Narváez-Díaz LA; Clínica de Tuberculosis y Enfermedades Pleurales, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER), Ciudad de México, México., Salas-Hernández J; Clínica de Tuberculosis y Enfermedades Pleurales, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER), Ciudad de México, México., González-Covarrubias V; Laboratorio de Farmacogenómica, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Ciudad de México, México., Soberón X; Laboratorio de Farmacogenómica, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Ciudad de México, México.
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