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Real-life impact of clinical metagenomics in the intensive care unit: a multicenter retrospective study in greater paris area hospitals.

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Title: Real-life impact of clinical metagenomics in the intensive care unit: a multicenter retrospective study in greater paris area hospitals.
Authors: Bay P; DMU Médecine, Service de Médecine Intensive Réanimation, AP-HP (Assistance Publique-Hôpitaux de Paris), Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, 1 Rue Gustave Eiffel, Créteil, 94010, France. pierre.bay@aphp.fr.; Faculté de Santé de Créteil, UPEC (Université Paris Est Créteil), IMRB, GRC CARMAS, Créteil, 94010, France. pierre.bay@aphp.fr.; UPEC (Université Paris Est Créteil) INSERM, Unité U955, Équipe 18, Créteil, 94010, France. pierre.bay@aphp.fr., Cappy P; UPEC (Université Paris Est Créteil) INSERM, Unité U955, Équipe 18, Créteil, 94010, France.; Department of Microbiology, GenoBioMICS Platform, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Université Paris-Est, Créteil, France., Rodriguez C; UPEC (Université Paris Est Créteil) INSERM, Unité U955, Équipe 18, Créteil, 94010, France.; Department of Microbiology, GenoBioMICS Platform, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Université Paris-Est, Créteil, France., Mongardon N; Université Paris Est Créteil, INSERM, IMRB, Créteil, F-94010, France.; École Nationale Vétérinaire d'Alfort, IMRB, AfterROSC Network, Maisons-Alfort, F-94700, France.; Service d'Anesthésie-Réanimation Et Médecine Péri-Opératoire, DMU CARE, Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP), Créteil, 94010, France., Petit M; Medical Intensive Care Unit, Ambroise Paré Hospital, APHP Inserm, CESP, University Versailles Saint Quentin, University Paris Saclay, Guyancourt, U1018, France., Voiriot G; GRC 40 SoLID, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Hôpital Tenon, Service de Médecine Intensive Réanimation, INSERM CRSA UMRS_938 Team 5PMed, Sorbonne Université, Paris, France., Sonneville R; UMR 1137, Université Paris Cité, INSERM, Paris, 75018, France.; APHP.Nord, Department of Intensive Care Medicine, Bichat-Claude Bernard University Hospital, Paris, 75018, France., Pineton de Chambrun M; UMRS_1166-ICAN, Service de Medecine Intensive Reanimation, iCAN, Institute of Cardiometabolism and Nutrition, INSERM, Hôpital de La Pitié-Salpêtrière, Sorbonne Universités, 47, Bd de L'Hôpital, Paris Cedex 13, 75651, France.; Medical Intensive Care Unit, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Pitié-Salpêtrière Hospital, Paris Cedex 13, 75651, France., Urbina T; Medical Intensive Care, Unit Hôpital Saint-Antoine Assistance Publique-Hôpitaux de Paris , Paris, France., Pham T; Service de Médecine Intensive-Réanimation, DMU CORREVE, Groupe de Recherche CARMAS, AP-HP, Hôpital de Bicêtre, FHU SEPSIS, Hôpitaux Universitaires Paris-Saclay, Le Kremlin-Bicêtre, France.; Inserm U1018, Equipe d'Epidémiologie Respiratoire Intégrative, Université Paris-Saclay, UVSQ, Univ. Paris-Sud, CESP, Villejuif, 94807, France., Decavèle M; Service de Médecine Intensive-Réanimation-SRPR, AP-HP, Groupe Hospitalier Universitaire APHP-Sorbonne Université, Site Pitié-Salpêtrière, Département R3S, Paris, France.; UMRS1158 Neurophysiologie Respiratoire Expérimentale Et Clinique, Sorbonne Université, INSERM, Paris, France., Benghanem S; Service de Médecine Intensive - Réanimation, Hôpital Cochin, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris. Centre, Université Paris Cité, 27 Rue du Faubourg Saint-Jacques, Paris, 75014, France.; INSERM U1016, CNRS UMR8104, Institut Cochin, Université Paris Cité, Paris, France., Contou D; Service de Réanimation Polyvalente, CH Victor Dupouy, Argenteuil, France., Lepeule R; Département Prévention Diagnostic Et Traitement Des Infections, AP-HP, Unité Transversale de Traitement Des Infections, Hôpital Henri Mondor, Créteil, 94000, France., Melica G; UPEC (Université Paris Est Créteil) INSERM, Unité U955, Équipe 18, Créteil, 94010, France.; Service de Maladies Infectieuses Et Immunologie Clinique, Hôpital Henri Mondor, 94000, Créteil, France., de Prost N; DMU Médecine, Service de Médecine Intensive Réanimation, AP-HP (Assistance Publique-Hôpitaux de Paris), Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, 1 Rue Gustave Eiffel, Créteil, 94010, France.; Faculté de Santé de Créteil, UPEC (Université Paris Est Créteil), IMRB, GRC CARMAS, Créteil, 94010, France.; UPEC (Université Paris Est Créteil) INSERM, Unité U955, Équipe 18, Créteil, 94010, France., Angebault C; Department of Microbiology, GenoBioMICS Platform, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Université Paris-Est, Créteil, France.; Dynamyc UR 7380, Faculté de Santé, USC Anses, Univ. Paris-Est Créteil (UPEC), Créteil, France., Mekontso Dessap A; DMU Médecine, Service de Médecine Intensive Réanimation, AP-HP (Assistance Publique-Hôpitaux de Paris), Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, 1 Rue Gustave Eiffel, Créteil, 94010, France.; Faculté de Santé de Créteil, UPEC (Université Paris Est Créteil), IMRB, GRC CARMAS, Créteil, 94010, France., Woerther PL; UPEC (Université Paris Est Créteil) INSERM, Unité U955, Équipe 18, Créteil, 94010, France.; Department of Microbiology, GenoBioMICS Platform, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Université Paris-Est, Créteil, France., Razazi K; DMU Médecine, Service de Médecine Intensive Réanimation, AP-HP (Assistance Publique-Hôpitaux de Paris), Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, 1 Rue Gustave Eiffel, Créteil, 94010, France.; Faculté de Santé de Créteil, UPEC (Université Paris Est Créteil), IMRB, GRC CARMAS, Créteil, 94010, France.
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Paris-Sud, CESP, Villejuif, 94807, France.<br /><searchLink fieldCode="AU" term="%22Decavèle+M%22">Decavèle M</searchLink>; Service de Médecine Intensive-Réanimation-SRPR, AP-HP, Groupe Hospitalier Universitaire APHP-Sorbonne Université, Site Pitié-Salpêtrière, Département R3S, Paris, France.; UMRS1158 Neurophysiologie Respiratoire Expérimentale Et Clinique, Sorbonne Université, INSERM, Paris, France.<br /><searchLink fieldCode="AU" term="%22Benghanem+S%22">Benghanem S</searchLink>; Service de Médecine Intensive - Réanimation, Hôpital Cochin, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris. Centre, Université Paris Cité, 27 Rue du Faubourg Saint-Jacques, Paris, 75014, France.; INSERM U1016, CNRS UMR8104, Institut Cochin, Université Paris Cité, Paris, France.<br /><searchLink fieldCode="AU" term="%22Contou+D%22">Contou D</searchLink>; Service de Réanimation Polyvalente, CH Victor Dupouy, Argenteuil, France.<br /><searchLink fieldCode="AU" term="%22Lepeule+R%22">Lepeule R</searchLink>; Département Prévention Diagnostic Et Traitement Des Infections, AP-HP, Unité Transversale de Traitement Des Infections, Hôpital Henri Mondor, Créteil, 94000, France.<br /><searchLink fieldCode="AU" term="%22Melica+G%22">Melica G</searchLink>; UPEC (Université Paris Est Créteil) INSERM, Unité U955, Équipe 18, Créteil, 94010, France.; Service de Maladies Infectieuses Et Immunologie Clinique, Hôpital Henri Mondor, 94000, Créteil, France.<br /><searchLink fieldCode="AU" term="%22de+Prost+N%22">de Prost N</searchLink>; DMU Médecine, Service de Médecine Intensive Réanimation, AP-HP (Assistance Publique-Hôpitaux de Paris), Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, 1 Rue Gustave Eiffel, Créteil, 94010, France.; Faculté de Santé de Créteil, UPEC (Université Paris Est Créteil), IMRB, GRC CARMAS, Créteil, 94010, France.; UPEC (Université Paris Est Créteil) INSERM, Unité U955, Équipe 18, Créteil, 94010, France.<br /><searchLink fieldCode="AU" term="%22Angebault+C%22">Angebault C</searchLink>; Department of Microbiology, GenoBioMICS Platform, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Université Paris-Est, Créteil, France.; Dynamyc UR 7380, Faculté de Santé, USC Anses, Univ. 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