ClinBioNGS: A Clinical Bioinformatics Pipeline for Integrated Analysis of Somatic Next-Generation Sequencing Cancer Panels.

Saved in:
Bibliographic Details
Title: ClinBioNGS: A Clinical Bioinformatics Pipeline for Integrated Analysis of Somatic Next-Generation Sequencing Cancer Panels.
Authors: Marín R; Unit of Bioinformatics for Precision Oncology (UBOP), Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Preclinical and Experimental Research in Thoracic Tumors (PRETT), Molecular Mechanisms and Experimental Therapy in Oncology Program (Oncobell), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; PhD Program in Bioinformatics, Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra, Barcelona, Spain.; Hereditary Cancer Program, Molecular Mechanisms and Experimental Therapy in Oncology Program (Oncobell), Institut Català d'Oncologia (ICO), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain., Alay A; Unit of Bioinformatics for Precision Oncology (UBOP), Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Preclinical and Experimental Research in Thoracic Tumors (PRETT), Molecular Mechanisms and Experimental Therapy in Oncology Program (Oncobell), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Ajenjo-Bauza M; Unit of Bioinformatics for Precision Oncology (UBOP), Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Preclinical and Experimental Research in Thoracic Tumors (PRETT), Molecular Mechanisms and Experimental Therapy in Oncology Program (Oncobell), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Hijazo-Pechero S; Unit of Bioinformatics for Precision Oncology (UBOP), Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Preclinical and Experimental Research in Thoracic Tumors (PRETT), Molecular Mechanisms and Experimental Therapy in Oncology Program (Oncobell), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Montironi C; Molecular Biology CORE. Center for Biomedical Diagnostics (CDB), Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain.; Pathology Department, Center for Biomedical Diagnostics (CDB), Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain.; Liver Cancer Translational Research Group, Liver Unit, Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS), Hospital Clínic, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain., Hernández-Illán E; Molecular Biology CORE. Center for Biomedical Diagnostics (CDB), Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain.; Pathology Department, Center for Biomedical Diagnostics (CDB), Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain., Jares P; Molecular Biology CORE. Center for Biomedical Diagnostics (CDB), Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain.; Pathology Department, Center for Biomedical Diagnostics (CDB), Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), Madrid, Spain.; Lymphoid Neoplasm Program, August Pi i Sunyer Biomedical Research Institute (IDIBAPS), Barcelona, Spain., Azuara D; Hereditary Cancer Program, Molecular Mechanisms and Experimental Therapy in Oncology Program (Oncobell), Institut Català d'Oncologia (ICO), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain.; Laboratory Core Molecular Analysis (L-CAM), Hospital Universitari de Bellvitge (HUB), Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain., Varela M; Laboratory Core Molecular Analysis (L-CAM), Hospital Universitari de Bellvitge (HUB), Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain.; Department of Pathology, Hospital Universitari de Bellvitge (HUB), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Vidal A; Laboratory Core Molecular Analysis (L-CAM), Hospital Universitari de Bellvitge (HUB), Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain.; Department of Pathology, Hospital Universitari de Bellvitge (HUB), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Puig-Butillé JA; Molecular Biology CORE. Center for Biomedical Diagnostics (CDB), Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain., Lázaro C; Hereditary Cancer Program, Molecular Mechanisms and Experimental Therapy in Oncology Program (Oncobell), Institut Català d'Oncologia (ICO), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), Madrid, Spain.; Laboratory Core Molecular Analysis (L-CAM), Hospital Universitari de Bellvitge (HUB), Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet del Llobregat, Barcelona, Spain., Moreno V; Consorcio de Investigación Biomédica en Red de Epidemiologia y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.; Oncology Data Analytics Program (ODAP), Institut Català d'Oncologia (ICO), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Universitat de Barcelona Institute of Complex Systems (UBICS), Universitat de Barcelona (UB), Barcelona, Spain.; Department of Clinical Sciences, Faculty of Medicine and Health Sciences, Universitat de Barcelona (UB). L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Cordero D; Unit of Bioinformatics for Precision Oncology (UBOP), Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Preclinical and Experimental Research in Thoracic Tumors (PRETT), Molecular Mechanisms and Experimental Therapy in Oncology Program (Oncobell), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Consorcio de Investigación Biomédica en Red de Epidemiologia y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain., Nadal E; Preclinical and Experimental Research in Thoracic Tumors (PRETT), Molecular Mechanisms and Experimental Therapy in Oncology Program (Oncobell), Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Department of Clinical Sciences, Faculty of Medicine and Health Sciences, Universitat de Barcelona (UB). L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Department of Medical Oncology, Institut Català d'Oncologia (ICO), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Solé X; Molecular Biology CORE. Center for Biomedical Diagnostics (CDB), Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona, Spain.; Translational Genomics and Targeted Therapies in Solid Tumors, August Pi i Sunyer Biomedical Research Institute (IDIBAPS), Barcelona, Spain.
Source: JCO clinical cancer informatics [JCO Clin Cancer Inform] 2026 Jan; Vol. 10, pp. e2500221. Date of Electronic Publication: 2026 Jan 08.
Publication Type: Journal Article
Journal Info: Publisher: American Society of Clinical Oncology Country of Publication: United States NLM ID: 101708809 Publication Model: Print-Electronic Cited Medium: Internet ISSN: 2473-4276 (Electronic) Linking ISSN: 24734276 NLM ISO Abbreviation: JCO Clin Cancer Inform Subsets: MEDLINE
Database: MEDLINE Ultimate
Description
ISSN:2473-4276
DOI:10.1200/CCI-25-00221